江汉大学是在原江汉大学、华中理工大学汉口分校、武汉教育学院和武汉市职工医学院的基础上合并组建的。1997年7月16日武汉市人民政府市长办公会听取了市教委《关于江汉大学等四所高等学校合并的建议方案》的汇报（武汉市人民政府市长办公会纪要1997年第10期）。1998年7月28日省教委召开组建新“江汉大学”论证会，通过专家论证。8月14日省人民政府向教育部上报《关于组建新江汉大学的函》（鄂政函[1998]104号）。11月12日市计委同意江汉大学迁址至武汉经济技术开发区规划建设项目立项（武计社[1998]443号）。
1999年4月29日教育部下达《关于同意江汉大学、华中理工大学汉口分校、武汉教育学院和武汉市职工医学院合并筹建新江汉大学的通知》（教发函[1999]9号），5月16日江汉大学新址建设奠基仪式在武汉经济技术开发区三角湖畔举行。2001年8月18日全国高校设置评议委员会专家组考察江汉大学筹建工作情况，10月17日教育部下达《关于同意组建新的江汉大学的通知》（教发函[2001]230号），12月10日省人民政府下达《关于组建新江汉大学的通知》（鄂政发[2001]83号），正式组建新的江汉大学，同时撤消原四所学校的建制。
2002年5月26日至6月20日，江汉大学整体搬迁至武汉经济技术开发区三角湖路新校区，9月25日经学校党委研究决定，确定10月17日（教育部《关于同意组建新的江汉大学的通知》的发布日）为校庆纪念日，10月17日隆重举行了江汉大学合并组建一周年暨揭牌庆典仪式。